С 2001 года параллельно с традиционным карточным ведется электронный каталог библиотеки, созданы базы данных книг, статей, трудов преподавателей, картотека книгообеспеченности, авторефератов, ВКР и т.д.

На рубеже ХХ-ХХI веков библиотека – крупнейшая вузовская библиотека г.Тобольска. Новый статус учебного заведения – определяет новые задачи и новые перспективы для развития библиотеки. Она занимала площадь 1154 м². В её фондах насчитывалось только книг более 355 тысяч томов и около 40 тысяч экземпляров учебно-методических, научно-популярных и художественных периодических изданий, около тысячи экземпляров электронных пособий. Количество посадочных мест в читальных залах составляло 320 единиц.

На современном этапе библиотека не сбавляет своих позиций. Созданный за многие годы справочно-библиографический аппарат максимально раскрывает весь фонд библиотеки и позволял читателю оперативно и качественно составлять библиографию и получать необходимую информацию. Библиотека помогает студентам, аспирантам, преподавателям и сотрудникам вуза активно приобретать не только профессиональные знания, но и культурные и общечеловеческие ценности. Это достигается путем организации как традиционных (книжно-иллюстративных выставок из фонда библиотеки, в т.ч. из фонда редких книг), так и новых форм обслуживания (литературный диллижанс, квесты, библиоперфомэнс и др.). В 2013 г. научная библиотека Тобольской социально-педагогической академии им. Д.И.Менделеева становится Лауреатом международной программы чтения «Расул Гамзатов – певец добра и человечности» Международного общественного фонда им. Р.Гамзатова.  

С 01.09.2015 г. научная библиотека становится ИБЦ Тобольского педагогического института им. Д.И.Менделеева (филиала) ТюмГУ. На сегодняшний день перед ИБЦ стоят новые трансформированные задачи, новые сложности и перспективные направления развития.